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AlphaFold2:揭示数千潜在药物分子的新视角

新药情报编辑 | 2024-06-20 |

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AlphaFold,一款革命性的人工智能蛋白质结构预测工具,自其诞生以来,在生物医药领域掀起了波澜。它不仅推动了药物发现的进程,还在近期研究中,帮助科学家们成功预测了大脑血清素受体的三维结构。基于这些预测,研究人员筛选出了可能与受体结合的潜在化合物,包括具有迷幻效果的分子,为治疗抑郁症焦虑症和成瘾症等精神疾病提供了新的治疗途径。

尽管AlphaFold在模拟化合物与蛋白质相互作用方面取得了显著成果,但研究也发现,其预测的蛋白质结构与实验结构之间存在微小差异,这可能导致在药物筛选中遗漏关键信息或识别出实验方法未能发现的化合物。为了深入理解这一现象,科学家们对σ2受体和5-HT2A受体的实验结构进行了虚拟筛选,并与AlphaFold2预测的结构进行了对比研究。他们合成并评估了基于两种结构筛选出的数百种化合物的活性,结果显示,无论是基于预测还是实验结构的筛选,药物候选分子的命中率都相当一致。

特别值得一提的是,AlphaFold2还帮助研究人员确定了能够激活5-HT2A受体的一系列药物分子,包括迷幻剂LSD。这一发现不仅凸显了AlphaFold2在药物发现领域的潜力,也表明即使使用不同的结构预测方法,仍然有可能发现有效的药物候选分子。这为未来的药物研发提供了新的视角。

 


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