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Cell - 泛素相关修饰因子Urm1调控应激依赖性相分离机制分析

新药情报编辑 | 2024-08-19 |

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近日,德国马克斯普朗克生物化学研究所的Sae-Hun ParkManajit Hayer-HartlF. Ulrich Hartl研究小组在权威期刊《Cell》上发表了一篇题为“Stress-dependent condensate formation regulated by the ubiquitin-related modifier Urm1的研究论文,揭示了在热应激或饥饿条件下,被Urm1修饰的靶蛋白能够增强可逆蛋白质凝聚物的形成。

在细胞应激反应中,热休克反应已被证明对稳定蛋白质结构至关重要。而最近的研究表明,细胞应激还会诱导细胞内环境的酸化,促进特定生物分子凝聚体的形成,尤其是应激颗粒(SGs)。其中,泛素和泛素相关修饰因子在细胞应激反应中起着重要作用。然而,相比其他泛素相关修饰因子,Urm1(泛素相关修饰因子1)的具体作用仍未被完全理解。Urm1不仅在tRNA硫化过程中作为硫载体,还在氧化应激下作为赖氨酸和丝氨酸导向的蛋白质修饰因子。

研究团队指出,在温度为37℃46℃的热应激条件下,酿酒酵母细胞内55 kDa以上的Urm1修饰蛋白质会大量积累,这些修饰后的蛋白质大部分是不溶性的。此外,研究人员通过LC-MS/MS分析,发现Urm1修饰主要集中在RNA结合蛋白(RBPs)上,其中不少与SGs相关。

为了进一步揭示Urm1在应激条件下的定位及其作用,研究人员表达并观察了内源性启动子驱动的mNG-Urm1蛋白。在热应激条件下,mNG-Urm1迅速聚集成细胞质和核内的病灶,并且这些病灶的数量和大小会随应激条件的加剧而增加。进一步的实验表明,Urm1修饰可以将未组装的核糖体蛋白和组装因子分隔到核仁周围,同时结合细胞质中的SGsUrm1E1样酶Uba4也在SGs中积聚,这表明Urm1修饰通过促进蛋白质分割和相分离来保护应激条件下的关键蛋白质。

本研究还发现,一个酸性pH值对于Urm1的自组装以及与其靶蛋白和Uba4的相互作用是必要的。酸化的细胞环境能够触发Urm1的自聚及其与其他蛋白的相互作用,从而促进应激相关蛋白质的Urm化。实验证明,Urm1缺失的酿酒酵母细胞在高温条件下表现出明显的生长缺陷,这与缺乏SGs形成有关,而非tRNA硫化不足所致。

综上所述,本文揭示了在细胞应激引起的凝聚体形成过程中,Urm1的关键调控作用。研究结果表明,Urm1修饰不仅促进了应激颗粒和核仁凝聚物的形成,还增强了细胞在应激条件下的恢复能力。然而,Urm1在调控相分离中的分子机制尚需进一步探讨,未来的研究应致力于揭示更为具体的调控细节及“De-Urmylation”的逆转机制。


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