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空间代谢组学分析助力ICI疗法预测生物标志物开发提速

新药情报编辑 | 2024-10-28 |

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免疫检查点抑制剂(ICI)在非小细胞肺癌(NSCLC治疗中表现出了巨大的潜力,但其疗效多数仅局限于少数患者。现有的生物标志物,如肿瘤突变负荷(TMB)和PD-L1,预测能力仍然有限。在2024年世界肺癌大会(WCLC)上,澳大利亚学者Kenneth O’Byrne博士指出,高TMBPD-L1阳性结果的预测准确性最多达到40%[1]

在一场题为预测未来:新型病理学评估和成像生物标志物的口头报告中,O’ Byrne教授介绍了如何通过空间代谢组分析(spatial metabolic mapping)破译单细胞分析揭示的肿瘤微环境特征。这些分析为加快ICI疗法相关生物标志物的开发提供了关键线索。为了更好地预测疗效,我们确实需要深入了解肿瘤微环境的复杂性,”O’ Byrne教授表示。

传统观点认为,含有大量炎症细胞的热肿瘤对治疗的敏感性更高。然而,单细胞分析指出,炎症细胞的存在与否并非免疫治疗效果的唯一预测因素。高度浸润的炎症细胞可能对ICI有效,而若炎症细胞被限制在肿瘤外部,治疗效果可能被削弱。尽管炎症细胞数量相似,它们之间的生物活性可能大不相同。

研究人员采取多模态分析方法,对45名接受ICI治疗的NSCLC患者的组织样本进行回顾性分析,寻找回应和无反应患者的差异特征。人工智能(AI)驱动的无监督聚类用于对细胞进行进一步分类。

通过无监督AI分析识别出43个不同的细胞亚群,这些亚群主要通过代谢状态和活化状态来区分。关键的差异表达蛋白包括氧化磷酸化标志物CSSDHAATPAS和代谢酶HK1GLUT1LDHA

此外,该研究发现了代谢状态与效应器功能(effector functions)以及组织定位之间的直接关系。代谢活跃的淋巴细胞表现出较高的PD-1MHC-IMHC-IICD44阳性水平。Treg细胞被确认是ICI治疗耐药的重要预测因子,这也与其他研究结果一致。

通过对细胞邻域(cellular neighborhoods)的研究,识别出包括与治疗反应有关的巨噬细胞混合肿瘤表型在内的10个不同邻域。O’Byrne教授提到,这种关联并不意外,因为巨噬细胞能够在穿透组织后分化,并在进入肿瘤后表现出抗肿瘤活性。

细胞交互分析进一步揭示了肿瘤细胞的三种主要代谢状态:OXPHOS阳性、OXPHOS阴性及PPP阳性。PPP阳性状态特征为ASCT2pNRF2G6PD的上调,包含更多PPP阳性肿瘤细胞(超过40%)的肿瘤对PD-1抑制剂耐药,导致总体生存率(OS)降低。O’Byrne教授指出,PPP高的肿瘤对治疗无应答,而PPP低的肿瘤则有较好的应答。

最后,O’Byrne教授强调,该技术的开发提供了有价值的信号,但须谨慎解读这一研究发现的意义。




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